A Gossypium mustelinum Miers é a única espécie genuinamente brasileira dentre as demais alotetraplóides do gênero. O seu centro de origem está no bioma da Caatinga. Criar um banco de germoplasma in vivo e ex situ representativo da variabilidade contida na espécie, avaliar parte dos acessos com marcadores moleculares SSR e realizar cruzamentos para iniciar a incorporação nos programas de melhoramento do algodoeiro foram os objetivos do trabalho efetuado pela Embrapa Algodão.
As práticas inadequadas da agropecuária na região contribuem para a elevada degradação das populações em seu ambiente natural. A diversidade genética total foi relativamente elevada (HE=0,472), indicando haver grande variabilidade nas populações. A maior proporção da diversidade está contida entre as populações, cujo índice FST de 0,58 é considerado extremamente elevado.
As populações se apresentaram muito diferenciadas, portanto não é possível priorizar as conservação de uma população em detrimento de outras. As estratégias para a preservação in situ e ex situ apenas serão adequadas caso as populações sejam resguardadas em seu ambiente. A geração F1, oriunda dos cruzamentos interespecíficos foi obtida para que, mais tarde, as gerações F2 e de retrocruzamentos sejam usadas para introdução de genes de interesse em estudos de melhoramento vegetal.
Para a montagem do banco de germoplasma foram obtidas estacas provenientes de plantas em casa-de-vegetação e coletadas in situ, tratadas com solução de ácido indol acético a 1% e plantadas em sacolas para mudas. O DNA genômico dos genótipos foi extraído e usado em reações de PCR para a obtenção de marcadores SSR. Realizaram cruzamento interespecífico de G. Mustelinum com cultivares de algodoeiro herbáceo – FM966, Deltaopal, BRS Cedro, BRS Buriti e BRS Safira.
As estacas foram transplantadas em período de chuva para campo lotado na Embrapa Algodão. Os dados genômicos foram usados para estimar as estatísticas F e a diversidade genética. A heterozigosidade observada foi baixa (Ho=0,061) e o índice de fixação ou endogamia elevado (FIS=0,74), revelando que a espécie se propaga por autofecundações e cruzamentos entre indivíduos aparentados.